在Nginx中，你可以通过配置不同的虚拟主机（Virtual Hosts）来实现同一个域名下运行多个应用程序。每个虚拟主机可以绑定到一个或多个IP地址和端口，并且可以通过HTTP头中的Host字段或者请求的URL路径来进行路由选择。

以下是一个基本的例子：

nginx
server {
listen 80;
server_name example.com;

location /app1/ {
root html/app1/;
index app1.html;
}

location /app2/ {
proxy_pass http://localhost:5000; 假设你的第二个应用是基于Flask或其他类似的框架构建的应用程序。
include proxy_params;
}
}

在这个例子中：
`listen` 指令指定了服务器监听哪个网络接口以及什么端口号；
`server_name` 是你想要这个站点响应的那个名字；
第二个location块定义了如何处理对 `/app1/` 开始的所有URI 的访问：它告诉 Nginx 使用位于文件系统根目录下的名为 html 目录里的子目录为 /app1/ 提供内容服务, 并将默认索引页设置成 index.php;
最后一个是另一个location指令用于处理所有以/app2/开始的uri 请求并将其代理给本地机器上的某个特定的服务(这里假设该服务正在使用http协议并且其socket是在本机上侦听于port :5000) 。这通常适用于需要与外部进程通信的情况比如Node.js或者其他支持WebSocket等长连接技术的语言编写的web应用

注意，在实际部署时，请确保已经安装好相应的软件包和服务以便它们能够正确地工作在一起！同时也要记得修改防火墙规则允许必要的流量进出这些端口等等操作！

此外还可以根据具体需求添加更多高级特性如SSL证书管理、日志记录等功能模块化设计使得整个网站更加健壮可靠易于维护升级扩展性更强!